İstiklal Caddesi üzerinde yer alan cami, 1596 yılında Galatasaray ağalarından biri olan Hüseyin Ağa tarafından yaptırılmıştır. Caminin avlu kapısının üzerinde II. Mahmud tuğralı sekiz satırlık bir kitabe bulunmaktadır.

Geçirdiği yangından sonra uzun bir süre bakımsız kalan cami, 1934 yılında Vakıflar tarafından yeniden onarılmış ve ibadete açılmıştır.

Mihrabı, duvarları ve minaresi eski yapıdan günümüze dek ayakta kalan caminin avlusunda Mimar Sinan’ın imzasını taşıyan bir şadırvan bulunmaktadır. Şadırvan, Okmeydanı’nda bulunan Sinan Paşa Camii’nden buraya nakledilmiştir. 3000 kişilik kapasitesi bulunan camide Hüseyin Ağa’nın ve yine Galatasaray ağalarından Davut Ağa’nın mezarları bulunmaktadır.